یکی از مهمترین بخش سیستم تصفیه استخر پمپ استخر میباشد و نبود ان باعث میشود پمپاژ آب به فیلتر صورت نگیرد؛ در نتیجه آب استخر هم تصفیه نمی شود. وجود سیستم تصفیه به همراه یک پمپ استخر جزع اصلی تمامی استخرها است. هر سیستم استخری باید حتما دارای فیلتر و پمپ باشد. پمپ با کشیدن آب با کمک اسکیمرهای استخر یا سرریز آب از حفره های دور استخر، آب را مکش می کند.پمپ استخر باید در مدت زمان مشخصی تمامی آب استخر را تعویض کرده و آن را به فیلتر برساند و بعد از تصفیه، مجددا به استخر باز گرداند. و بعد از عبور از فیلتر، آب بعد از گذر از سایر بخش های سیستم تصفیه همچون کلرزن نمکی و دستگاه UV به وسیله جت ها به استخر بر می گردد.
این نوع پمپ آب را از طریق اسکیمر یا سرریز مکش می کند. یک اسکیمر در بالای قسمت عمیق استخر و دریچه مکش در عمیق ترین قسمت استخر تعبیه می شود تا آب به سمت پمپ هدایت شود. برای بهترین عملکرد باید ارتفاع نصب پمپ پایین تر از ارتفاع دریچه مکش باشد چونکه با این کار دقیقا زیر مرکز ثقل استخر قرار گرفته و مکش به نحو احسنت انجام می شود. علت انجام این کار برای تامین فشار کافی آب برای پمپ است.و یکی از مهم ترین نکته ها که یادآوری آن خالی از لطف نیست این است که ذر زمان طراحی و اجرای استخر باید چاه محل پمپ استخر نیز تعبیه گردد در غیر این صورت دیگر نمی توان پمپ را نصب کرد و اجبارا باید از پمپ های مستغرق و یا جاروهای مخصوص استخر استفاده شود که به جای هدایت آب استخر به سیستم تصفیه آب دور ریخته می شود. زیرا آب به جای تصفیه هدر میرود، مصرف گاز، برق و مواد شیمیایی (کلر و اسید) بسیار بالا می رود.